MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Enterococcus faecalis D32 plasmid EFD32pA

Total Repeats: 93

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018222	GTTT	2	8	1537	1544	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018222	GTG	2	6	1551	1556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018222	TGAT	2	8	1562	1569	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018222	TATT	2	8	1596	1603	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018222	GAAGC	2	10	1693	1702	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_018222	AATTT	2	10	1720	1729	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018222	T	6	6	1727	1732	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018222	AAT	2	6	1756	1761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018222	ATT	2	6	1778	1783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018222	TATT	2	8	1818	1825	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018222	AAGT	2	8	1836	1843	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018222	TAA	2	6	1907	1912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018222	ATT	2	6	1917	1922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018222	TG	3	6	1993	1998	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018222	GTA	2	6	2050	2055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018222	A	7	7	2120	2126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018222	ATA	2	6	2254	2259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018222	GGA	2	6	2260	2265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018222	GGTT	2	8	2443	2450	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018222	TA	3	6	5244	5249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018222	TTG	2	6	5292	5297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018222	ATAAGA	2	12	5306	5317	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018222	AGAA	2	8	5324	5331	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018222	AAG	2	6	5608	5613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018222	ATAA	2	8	5702	5709	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018222	ACAA	2	8	5773	5780	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_018222	TATT	2	8	5796	5803	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018222	T	6	6	6585	6590	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018222	ATT	2	6	6632	6637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018222	TAC	2	6	6643	6648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_018222	AAG	2	6	6660	6665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018222	CAA	2	6	6767	6772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018222	A	7	7	6782	6788	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018222	GTT	2	6	6799	6804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018222	AGAA	2	8	6846	6853	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018222	A	6	6	6852	6857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018222	AT	3	6	6971	6976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018222	TA	3	6	7029	7034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018222	TGA	2	6	8052	8057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018222	AAG	2	6	8071	8076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018222	AGAA	2	8	8081	8088	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018222	A	7	7	8152	8158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018222	AAATG	2	10	8319	8328	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018222	A	6	6	8342	8347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018222	TGAAAT	2	12	8352	8363	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018222	AAT	2	6	9410	9415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018222	GGA	2	6	9431	9436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018222	ATC	2	6	10130	10135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_018222	ATC	2	6	10211	10216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_018222	TTC	2	6	10218	10223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_018222	TCA	2	6	10243	10248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_018222	CTTA	2	8	10288	10295	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_018222	TTG	2	6	10300	10305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018222	TA	3	6	10333	10338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018222	TTG	2	6	10429	10434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018222	ACTC	2	8	10448	10455	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_018222	ATTGT	2	10	10520	10529	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018222	CTT	2	6	10568	10573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_018222	T	6	6	10594	10599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018222	ATT	2	6	10604	10609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018222	TTA	2	6	10611	10616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018222	TTA	2	6	10628	10633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018222	TCT	2	6	10742	10747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_018222	ATG	2	6	10787	10792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018222	TTA	2	6	10819	10824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018222	A	7	7	10837	10843	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018222	GGAA	2	8	10859	10866	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018222	GA	4	8	11517	11524	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018222	AATG	2	8	11596	11603	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018222	T	8	8	11669	11676	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018222	TCG	2	6	11727	11732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_018222	GTG	2	6	11785	11790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018222	CAAT	2	8	11794	11801	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_018222	GTT	2	6	11809	11814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018222	ATAA	2	8	11955	11962	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018222	TTTTC	2	10	12026	12035	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_018222	TTG	2	6	12061	12066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018222	A	7	7	12110	12116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018222	AC	3	6	12223	12228	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_018222	ATT	2	6	12517	12522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018222	T	8	8	12529	12536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018222	AT	3	6	12566	12571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018222	ACCA	2	8	12619	12626	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_018222	TAT	2	6	12713	12718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018222	CAAA	2	8	12721	12728	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_018222	TAG	2	6	12738	12743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018222	TTA	2	6	12752	12757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018222	GAA	2	6	12771	12776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018222	TAG	2	6	12785	12790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018222	ATCA	2	8	12799	12806	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_018222	TGAT	2	8	12814	12821	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018222	T	6	6	12825	12830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018222	T	6	6	12867	12872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.